如果实验室的整体环境不洁净，空气中含有的微生物和其他污染物可能会进入生物安全柜，导致污染。如果生物安全柜内部发现了污染，大部分都是霉菌、支原体污染，可以采取以下措施进行处理：
1.立即停用：一旦发现生物安全柜内部有细菌、霉菌污染，应立即停用该安全柜，避免继续使用造成更大范围的污染。
2.清除微生物：使用适当的清洁剂和消毒剂对生物安全柜内部进行全面的清洁和消毒，以清除霉菌及其孢子，如条件允许，可使用过氧化氢熏蒸的方式进行全面清洁。
3.加强实验室通风：增加实验室的通风换气次数，降低室内湿度，有助于减少霉菌的生长和繁殖。每日一定期消毒预防，每隔大周期可进行全面大消。
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