生物安全柜广泛应用在疾病预防与控制、医疗卫生、食品卫生、生物制药、环境监测以及各类生物实验室等领域，是保障生物安全和环境安全的重要基础。国际领域中生物安全柜执行的最重要的标准是欧洲标准EN12469和美国国家卫生基金会的第49号标准。根据生物安全柜的气流和隔离屏障设计可分为3个等级：Ⅰ级、Ⅱ级(A1、A2、B1、B2型)和Ⅲ级。在各类以基因、病毒、菌类等有研究的，特别是致病菌研究的环节会用到它，部分药厂等小试、中试车间的检测室也会采购生物安全柜。
一般应根据实验样品的生物危害程度和生物安全柜的生物安全防护水平来选择生物安全柜，Ⅰ级生物安全柜保护工作人员和环境，Ⅱ级生物安全柜保护工作人员、环境和实验样品。Ⅲ级生物安全柜采用手套箱形式，能更严格地保护工作人员、环境和实验样品。
哪些情况下需要配置生物安全柜?
1.病原微生物气溶胶或飞溅操作应在生物安全柜二级生物安全柜内进行。
2.高浓度或大容量传染性物质的处理，必须在生物安全柜(以二级生物安全柜为宜)或其他物理约束设备中进行，并应使用个人防护用品。
3.上述材料的离心操作如使用密封离心转子或安全离心杯，可在实验室内进行，且仅在生物安全柜内开合，装载感染性材料。
生物安全柜的工作原理
将柜内空气向外抽吸，使柜内保持负压状态，通过垂直气流来保护工作人员免受有毒有害气体的侵害。外界空气经高效空气过滤器( high-efficiency particulate air filter, HEPA过滤器)过滤后进入安全柜内，以避免处理样品被污染。安全柜内的空气也需经过高效过滤器过滤后再排放到大气中，以达到保护实验室环境的目的。
在实际应用中，Ⅱ级生物安全柜为临床生物防护中应用最普遍的生物安全柜。临床中处理高浓度或大容量感染性材料时，以Ⅱ级生物安全柜应用最多。按照美国NSF49标准，一般将Ⅱ级生物安全柜划分为A1、A2、B1、B2四个类型。
A1型：a.维持穿过工作台开口面的最小平均吸入口风速(计算或测量值)为0.38m/s(75ft/min);b.由静压箱送出的，经HEPA过滤器过滤的垂直气流是垂直气流和吸入气流混合后的一部分(即柜内70%气体通过HEPA过滤器再循环至工作区，30%的气体通过排气口HEPA过滤器过滤排除);c.允许经排出口HEPA过滤器过滤后的气流返回实验室;d.允许有正压的污染风道和静压箱。
A2型：a.维持穿过工作台开口面的最小平均吸入口风速为0.5m/s;b.经HEPA过滤器过滤后的垂直气流是由静压箱排出的垂直气流和吸入气流混合后的一部分(即柜内30%气体通过排气口HEPA过滤器排除，70%的气体通过供气口HEPA过滤器再循环至工作区);c.必须经HEPA过滤器过滤后，所有废气才能排到室外，但废气不可再进入安全柜循环或返回实验室;d.所有被生物污染的风道和静压箱应保持负压或者被负压的风道和静压箱包围。
B1型：a.维持穿过工作台开口面的最小平均吸入口风速(计算或测量值)为0.5m/s(100ft/min);b.经HEPA过滤器过滤后的垂直气流中的绝大部分是由未污染的循环吸入气流组成(即柜内70%气体通过排气口HEPA过滤器排除，30%的气体通过供气口HEPA过滤器再循环至工作区);c. 经HEPA过滤器过滤后的大部分污染的垂直气流，通过专用风道过滤后排入大气;d.所有被生物污染的风道和静压箱应保持负压，或被负压的风道和静压箱包围。
B2型(也称为“全排”型)：a.维持穿过工作台开口面的最小平均吸入口风速(计算或测量值)为0.5m/s(100ft/min);b.经HEPA过滤器过滤后的垂直气流是由实验室或室外空气送入的(即：安全柜中排出的气体不进入垂直气流的循环过程);c.所有的吸入气流和垂直气流经HEPA过滤器过滤后排入大气，不再进入安全柜循环或返回实验室;d.所有污染的风道和静压箱应保持负压，或是被直接排风的风道和静压箱包围。
在实际的设计工作中，有经验的洁净设计师会根据项目的行业、实验/检测的具体流程(工艺),结合空间的布局及操作的病原微生物的危险水平等情况来确定需要配备的生物安全柜类型，且同步给予通排风、工艺管道、消防自控等技术层面的配置。
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